Nació en el La Rivera, Jalisco. Activista de los derechos académicos y humanos. Él ha sido profesor e investigador para El Colegio de México desde 1977 y un miembro del sistema nacional de los investigadores mexicanos (Sistema Nacional de Investigadores de México.)

Investigador en Colegio de México y ha enseñado en el Centro de Investigación y Docencia Económicas  (CIDE), Universidad Nacional Autónoma de México, (UNAM) y sido un profesor de la huésped en las varias universidades nacionales e internacionales.

Él era un miembro fundador del periódico La Jornada y el compartimiento Este País. Es columnista para Reforma y otros periódicos mexicanos, y participan como analista en la demostración de la televisión Plano superelegante, una difusión política de la demostración del análisis en  Instituto Politécnico Nacional (canal 11), para que él recibió el premio del periodismo de José Pagés Llergo . Además, es columnista de la huésped para el periódico español El País.

Sergio Aguayo recibió su BA en relaciones internacionales en El Colegio de México. Obtuvo sus amos, PhD y estudios graduados en Johns Hopkins’ Paul H. Escuela de Nitze de los estudios internacionales avanzados (SAIS). A partir de 1990 a 1996 fue presidente de la Academia Mexicana de Derechos Humanos , y a partir la 1994 a 1999 fue miembro de la coordinación nacional de Alianza Cívica. preside actualmente la Asociación Política Nacional Propuesta Cívica. El Dr. Aguayo es presidente de la junta directiva de Fundar, Centro de Análisis e Investigación.

Algunas de sus publicaciones:

• El Alamanac mexicano
• Almanac México-Unido de los estados  
• Diagnosis en la situación de derechos humanos en México
• El “Charola”: Una historia de los servicios de inteligencia en México
• El cementerio de mitos: los Estados Unidos y el Nationalism mexicano
•  Los archivos de Violence .